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蝙蝠一般都有冬眠的习性，冬眠的地点大多选在洞里。冬眠时，它们的新陈代谢减缓，呼吸和心跳每分钟仅有几次，血流的速度减慢，它们的体温也会降低到与环境温度相一致。不过，蝙蝠的冬眠并不深，有时还会排泄和进食呢。
蝙蝠的种类有很多，生活在热带地区的一些种类是不用冬眠的，但冬天较冷的地带则大多都要冬眠，因为蝙蝠的食物多是昆虫，而昆虫在冬天是蛰伏期或者是正在卵中等待孵化，蝙蝠没的吃就只能冬眠熬过 去。 因此说，好多冬眠的动物并不是因为怕冷，而是因为缺乏食物，比如棕熊这样的家伙，它们就不怎么怕冷，脂肪多毛又厚，可是它们生活的地方靠近北极圈，本来食物就不是很充足，每年除冬眠外大部分时间都在狂吃东西储备脂肪，一到冬天，食物就很难找到了，经常是浪费了100单位的能量却只找到了1单位能量的食物，得不偿失，为了不被饿死，于是便只好找个地方睡觉，或躺着不动，让身体的消耗保持在一个很低的状态，依靠身体储存的脂肪熬着等待春暖花开，长此以往的进化便形成了冬眠的习性。 另外，海参这种动物不冬眠，却要夏眠，和冬眠的原因类似，这也是因为海参的食物在夏天很少，为了活下去只好采取休眠的办法熬过去，等夏天一过食物充足了再醒来捕食。所以，不论冬眠还是夏眠都是动物为了适应环境而进化的结果。
一般冬眠时间从12月到次年2月下旬
蝙蝠有冬眠的习性，冬眠时新陈代谢的能力降低，呼吸和心跳每分钟仅有几次，血流减慢，体温降低到与环境温度相一致，但冬眠不深，在冬眠期有时还会排泄和进食，惊醒后能立即恢复正常。
蝙蝠一般给人们留下的最深刻的印象是善于在夜间活动，但是有些种类的蝙蝠还有另一种不广为人知的本领——冬眠。并不是所有种类的蝙蝠都会冬眠，只有那些生活在较高纬度地区的某些种类的蝙蝠，由于在漫长寒冷的冬季不能捕捉到足够的昆虫作为口粮而不得不学会了冬眠的本领。
在它们的冬眠期里，它们会蜷缩在屋顶或者墙角的缝隙里，看起来就像一个毛茸茸的小圆球。
会冬眠的蝙蝠一般会使自己进入一种深度的睡眠状态，有时这种状态会长达六个月，而其间的能量供应仅仅依靠蝙蝠储存在身体里的几克脂肪。它们通过降低体温和减缓新陈代谢速度的办法来减少能量消耗，这时它们的心跳会降到每分钟只跳十下。
当大地回春时，会冬眠的蝙蝠们常常会消耗掉体内的很多能量，使其体重下降到几乎是原来的一半。冬眠活动虽然对某些蝙蝠具有很重要的意义，但是这一行为的有害之处也是不可小视的。
北美蝙蝠研究与保护中心的科学家贾斯廷·博耶斯解释说，在冬眠期间，蝙蝠新陈代谢产生的废物会阻碍免疫系统的正常工作，近期的几项研究结果表明，当这些蝙蝠积累了足够多的脂肪的时候，它们就会尽可能地缩短冬眠时间，以减轻冬眠副作用带来的危害。
而大多数生活在热带和亚热带地区的蝙蝠，由于全年都有充足的食物供应，所以几乎完全不需要冬眠。